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Peixes-papagaio são principalmente herbívoros. A sua dieta consiste principalmente de algas, algas marinhas e outra matéria vegetal. Usam os seus dentes em forma de bico para raspar algas de rochas e coral.
Peixes-papagaio são essenciais para a saúde dos recifes de coral porque controlam o crescimento de algas e impedem que estas sufocam o coral. Os seus sistemas digestivos estão adaptados para decompor matéria vegetal.
Há alguma evidência de que peixes-papagaio podem ocasionalmente comer pequenos invertebrados como plâncton ou vermes, mas isso não é uma parte significativa da sua dieta.