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Filovírus são filamentosos, envelopados, não segmentados, RNA de fita simples, sentido negativo. Ao microscópio eletrónico, aparecem como partículas longas, delgadas, em forma de fio, com nucleocapsídeo helicoidal rodeado por matriz proteica e envelope externo com espículas de glicoproteína. Estas espículas ligam-se a recetores de superfície celular para entrar nas células hospedeiras. Filovírus variam de 80 a 1400 nm de comprimento e 80 a 100 nm de diâmetro.