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A criação seletiva não garante que todos os filhos sejam de qualidade superior. Embora a criação seletiva possa aumentar a probabilidade de obter filhos com características desejadas, ela não elimina a influência da variação genética e outros fatores que podem afetar o fenótipo de um indivíduo. Alguns filhos podem herdar características menos desejáveis ou podem ser influenciadas por fatores ambientais que limitam sua expressão das características desejadas. Além disso, a criação seletiva é limitada pela diversidade genética disponível na população que está sendo criada.