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O uso de microchips tornou-se popular para pets para poder encontrá-los e identificá-los caso se percam. Microchips são minúsculos dispositivos eletrônicos colocados dentro de cilindros de vidro. Cada um é programado com seu próprio código de identificação único e colocado em um banco de dados. Acesso a esses códigos é dado a abrigos de animais e veterinários para ajudar a identificar animais perdidos e devolvê-los aos tutores legítimos. Existem vantagens e desvantagens nesses dispositivos.
Devido à superpopulação de cães e gatos, muitas vezes abrigos ficam superlotados e acabam tendo que eutanasiá-los. Uma das vantagens dos microchips é que eles podem prevenir muitas dessas eutanásias porque o tutor do cão ou gato é mais provável de ser encontrado e o animal devolvido. O banco de dados para pets com microchip é nacional, o que torna muito mais fácil reunir-se com seu pet mesmo se ele viajou longa distância de casa.
Originalmente, microchips eram extremamente caros. Novos designs são dramaticamente mais baratos que os originais. Além disso, microchips são facilmente implantados logo sob a pele da orelha do pet. Estes dispositivos são feitos principalmente de silício e em tamanho não são maiores que um grão de arroz.
Houve alguns relatos de animais com microchips que desenvolveram tumores e câncer. Segundo Keith Johnson, patologista toxicológico da Dow Chemical Company, os transponders nos microchips são a causa desses tumores e cânceres. Além disso, segundo periódicos veterinários e de toxicologia, estudos conduzidos entre 1996 e 2006 revelaram que ratos e camundongos de laboratório injetados com microchips às vezes desenvolveram tumores malignos, com a maioria desses crescimentos envolvendo-se ao redor dos implantes de microchip.
Como há muitas empresas produzindo e comercializando microchips para pets, nem todos são compatíveis. No caso de um microchip ser lido por um scanner incompatível, o animal corre risco de identificação errada ou não ser identificado de todo. Quando isso ocorre, há forte chance do animal não ser devolvido ao lar, mas eutanasiado.