Os principais inimigos dos pinguins são:
Focas-leopardo, orcas, focas-de-pelo e tubarões são predadores naturais. Atacam pinguins na água, onde são menos ágeis e vulneráveis.
Pesca excessiva, poluição e mudanças climáticas também prejudicam pinguins e habitats. Pesca excessiva reduz alimento; poluição e clima destroem áreas de reprodução e interrompem cadeias alimentares.
Destruição de habitats por urbanização, mineração e turismo também impacta negativamente populações de pinguins.