O número e a estrutura dos cromossomos podem ajudar a determinar relacionamentos evolutivos entre espécies. Número cromossômico é característica de espécie — por exemplo, humanos têm 23 pares enquanto chimpanzés têm 24 pares. Estrutura cromossômica, incluindo padrões de bandamento e localizações gênicas, também pode ser comparada para identificar regiões de semelhança e diferença. Analisando essas características, cientistas obtêm insights sobre como espécies são relacionadas evolutivamente.