Habitats do Mississippi — do Delta do Rio Mississippi às encostas dos Apalaches — suportam ampla variedade de vida vegetal e animal.
O estado apresenta carvalhos, hickories, bordos, ciprestes-calvos, tupelos e pinheiros. Flores silvestres como azaleias, cornus e magnólias florescem na primavera. Solo fértil do Delta produz milho, soja, algodão e arroz.
Mamíferos incluem veados-de-cauda-branca, esquilos, coelhos, linces, e pequena população de ursos-negros. Mais de 300 espécies de aves vivem aqui, incluindo águias-carecas, águias-pescadoras e jaburus. Répteis e anfíbios variam de tartarugas e cobras a sapos e jacaré-americano. Rio Mississippi e águas costeiras suportam bagres, robalos, crappies, linguados, vermelhos e trutas.
Paisagens variadas do Mississippi fazem dele refúgio para biodiversidade.