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As atividades humanas são a principal causa de morte dos peixes-boi. Estas incluem caça direta, emaranhamento acidental em equipamentos de pesca, colisões com barcos e hélices, perda e degradação de habitat devido ao desenvolvimento costeiro, e poluição da água por pesticidas, fertilizantes, óleo e esgoto. As alterações climáticas também afetam os peixes-boi ao perturbar o fornecimento de alimentos e aumentar a vulnerabilidade a doenças.