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Habitats cinza, também chamados "habitats marginais", são ambientes capazes de sustentar vida mas oferecendo número mínimo de recursos e nutrientes. Nelas residem extremófilos, microrganismos adaptados a condições extremas.
Devido à falta de recursos, habitats cinza são considerados sítios de transição, onde microrganismos residem temporariamente enquanto se adaptam a ambientes mais favoráveis, ou permanentemente, se possuem adaptações ou simbiose que permitem sobreviver no ambiente de recursos limitados. Exemplos: