Componentes não-vivos de Bornéu incluem:
- Rochas e minerais: xistos e gnaisses antigos, além de carvão, ouro, cobre e diamantes.
- Cavernas: extensos sistemas calcários como as Cavernas de Mulu, abrigando a Câmara de Sarawak.
- Praias e areia: litorais nos mares da China Meridional, Sulu e Celebes com tipos variados de areia.
- Solo: solos diversos, desde solos ácidos de pântanos de turfa a solos vulcânicos férteis.
- Corpos d'água: mares, recifes de coral, manguezais e rios como Kapuas e Rajang.