Fósseis podem ser destruídos por erosão, glaciação, atividade vulcânica, terremotos e construção humana como estradas e edifícios.
Processos químicos como dissolução por água ou ácidos, oxidação e hidrólise podem destruir fósseis.
Escavação animal, crescimento de raízes de plantas e atividade de microrganismos podem danificar ou decompor fósseis.