Animal é dito hipoalergênico se menos provável de desencadear reação alérgica em alérgicos. Certos animais produzem significativamente menos alérgenos. Muitos consideram chinchilas hipoalergênicas, pois produzem baixos níveis de alérgenos, e alérgicos geralmente podem tê-las sem efeitos. Porém, suprimentos como feno e pó ainda podem causar reação.
Chinchilas são consideradas boa opção para quem sofre de alergia a animais mas quer pet. Produzem pouca ou nenhuma caspa, um dos principais carregadores de alérgenos, e menos prováveis de desencadear reação. Porém, existem muitos alérgenos animais. Além de caspa, urina e saliva carregam alérgenos que afetam alérgicos. Pelo ou células de pele da chinchila podem não irritar, mas donos ainda entram em contato com outros alérgenos que produzem.
Pessoas com alergias podem não ser afetadas pela chinchila mas reagir aos suprimentos de alimentação e cuidado. Feno é essencial na dieta. Feno timothy e alfafa são melhores mas podem causar febre do feno em dono alérgico. A cama da chinchila também pode causar reação. Donos unwilling a fornecer bom feno e cama de qualidade por causa de alergias não devem manter esses pets.
Chinchilas têm pelagem luxuosa, mas não a limpam banhando em água. Em vez disso, tomam banhos de pó. Na natureza, cobrem-se de cinza vulcânica. Pets precisam de pó especial para banhar cerca de duas vezes por semana. Esse pó pode causar reação em alérgicos. Não permitir banho de pó é cruel e desumano, pois o pó mantém a chinchila limpa e gerencia a pelagem.
Pessoas já suscetíveis a reações alérgicas causadas por animais podem ver sintomas piorarem com exposição prolongada. Portanto, pessoas com alergias graves ou asma não devem escolher chinchila. Pessoas com alergias controláveis devem consultar médico antes de conviver com chinchila ou escolher uma como pet.