Não há subespécies distintas de ornitorrincos reconhecidas pelos cientistas.
Embora existam algumas variações geográficas ligeiras nas características, não são consideradas significativas para justificar classificações de subespécies separadas.
Por exemplo, ornitorrincos no Queensland tendem a ser ligeiramente maiores que os da Tasmânia. No entanto, estas diferenças não são consistentes em todos os indivíduos das duas regiões, e há sobreposição significativa de tamanho entre ornitorrincos de ambos locais.
No geral, ornitorrincos do Queensland e Tasmânia são essencialmente a mesma espécie. Ligeiras variações observadas provavelmente devidas a fatores ambientais locais, como disponibilidade de alimento e clima, não diferenças genéticas.