Ratos-canguru enfrentam ampla gama de inimigos naturais dependendo do habitat:
Predadores: Aves de rapina como corujas, falcões e águias; cobras incluindo cascavéis e cobras-gopher; mamíferos como coiotes, raposas, linces, texugos, doninhas e até correcaminhos.
Outras Ameaças: Atividade humana como destruição de habitat e atropelamentos, competição com outros roedores, e doenças podem impactar populações.
A mistura específica de predadores varia por localização geográfica e disponibilidade de presas.