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Reprodução: A cloaca transfere esperma durante o acasalamento e expel ovos fertilizados durante a postura.
Excreção: Serve como abertura comum para sistemas digestivo, urinário e reprodutivo, expelindo resíduos como guano.
Armazenamento de esperma: Em algumas espécies, a cloaca do macho armazena esperma para viabilidade prolongada.
Glândulas odoríferas: Certas espécies têm glândulas odoríferas cloacais que produzem sinais químicos para marcação de território ou atração de parceiros.
Excreção de sal: Algumas aves marinhas têm glândulas de sal perto da cloaca para regular níveis de sal e prevenir desidratação.