Kentucky abriga pelo menos 17 espécies documentadas de morcegos, incluindo:
- Morcego-vermelho-oriental (Lasiurus borealis) – marrom-avermelhado, comum em todo o estado
- Morcego-cinzento (Lasiurus cinereus) – maior morcego do Kentucky, com pelo marrom-claro ou cinza
- Morcego-prateado (Lasionycteris noctivagans) – pelagem escura com pontas prateadas, encontrado em áreas arborizadas
- Pipistrelo-oriental (Perimyotis subflavus) – um dos menores morcegos do Kentucky
- Morcego-marrom-grande (Eptesicus fuscus) – comum em todo o estado
- Morcego-marrom-pequeno (Myotis lucifugus) – uma das espécies mais abundantes
- Morcego-de-orelhas-longas-do-norte (Myotis septentrionalis) – encontrado em áreas florestadas, com orelhas longas
Outras espécies possíveis incluem morcego-de-orelhas-grandes-de-Rafinesque, morcego-vespertino, morcego-seminole e morcego-tricolor.