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No primeiro experimento de Mendel, o traço que parecia desaparecer na prole era o traço recessivo.
Mendel cruzou plantas de ervilha puras com traços contrastantes. Por exemplo, cruzou uma planta com sementes lisas (traço dominante) com uma de sementes rugosas (traço recessivo). A primeira geração (F1) exibiu apenas o traço dominante. No exemplo das sementes, todas as plantas F1 tinham sementes lisas. Isso levou Mendel a acreditar que o traço recessivo havia desaparecido.
No entanto, o traço recessivo reapareceu na segunda geração (F2). Quando Mendel permitiu que as plantas F1 se autopolinizassem, aproximadamente 25% da geração F2 exibiu o traço recessivo.
Isso levou Mendel a concluir que os traços não se misturam, mas são transmitidos como unidades distintas, hoje conhecidas como genes. O gene dominante mascara a expressão do recessivo na geração F1, mas o gene recessivo ainda está presente e pode reaparecer em gerações posteriores.