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Chihuahuas de olhos verdes não são raros, mas são menos comuns que olhos castanhos, pretos ou avelã.
A cor dos olhos em cães é poligênica. Olhos verdes resultam de quantidade moderada de melanina no estroma da íris + dispersão de luz (efeito Tyndall). São mais frequentes em cães com pelagem merle, azul (diluição de preto), chocolate ou isabela.