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Os macacos capuchinhos foram descritos pela primeira vez por Georges-Louis Leclerc, Conde de Buffon , em 1766 .
Embora a data exata de sua descoberta seja desconhecida, a descrição de Buffon do "Sapajou à Capuchon" (Sapajou com capuz) em seu "histoire naturelle" é considerado o primeiro reconhecimento formal das espécies.
O nome "capuchinho" vem das vestes encapuzadas usadas por frades capuchinhos , que se assemelham à distinta coloração escura dos macacos ao redor da cabeça.