Muitas espécies de animais ajudam a fazer as culturas crescerem controlando diferentes organismos no agroecossistema. Por exemplo, besouros predatórios, como joaninhas e besouros moídos, alimentam -se de pulgões, moscas brancas e outros pequenos insetos que podem danificar as culturas. Além disso, aranhas, vespas parasitárias e pássaros atacam pragas de insetos que se alimentam de culturas. Por fim, certas minhocas, insetos, pequenos mamíferos e animais maiores (como elefantes e hipopótamos) contribuem para a inclinação e a aeração do solo, o que ajuda a cultivar.
Além disso, existem várias espécies que podem danificar as culturas em determinados momentos, além de beneficiar a mesma colheita em outras épocas do ano. Por exemplo, joaninhas se alimentam principalmente de insetos, mas são conhecidos por comer pólen e frutas de plantas também. As abelhas são essenciais para polinizar muitas plantas, mas, ao mesmo tempo, também podem espalhar pragas e doenças de planta para planta. Da mesma forma, muitas espécies de pássaros se alimentam de insetos que danificam as colheitas, mas também podem espalhar sementes de ervas daninhas indesejáveis que competem com as colheitas.