O termo "fazenda industrial" abrange muitas práticas, e substâncias usadas dependem do tipo de animal, práticas da fazenda e regulamentações do país.
Hormônios de crescimento como somatotropina bovina recombinante (rBST) são usados em gado e suínos. Outros hormônios podem ser usados para sincronização de prenhez ou manejo do ciclo reprodutivo.
Antibióticos, pesticidas e herbicidas em culturas de ração, medicamentos antiparasitários, e analgésicos ou sedativos para procedimentos.
Regulamentações diferem por país. Preocupações do consumidor levaram a demanda por produtos orgânicos e livres de hormônios. Algumas fazendas usam práticas baseadas em pasto ou orgânicas que evitam certos produtos químicos e hormônios.