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Florações algais podem alterar dramaticamente ecossistema de lagoa, afetando organismos em todos os níveis da teia alimentar.
Florações frequentemente envolvem crescimento explosivo de certas espécies de fitoplâncton. Embora essas algas microscópicas formem base da cadeia alimentar aquática, crescimento excessivo cria desequilíbrio. Populações de zooplâncton podem inicialmente disparar em resposta a alimento abundante, mas podem colapsar quando floração morre, deixando menos alimento para espécies acima na cadeia.
Peixes que dependem de zooplâncton podem enfrentar escassez de alimento após declínio de floração, o que pode afetar crescimento, reprodução e saúde populacional geral.
Tapetes densos na superfície de florações algais podem bloquear luz solar de atingir fundo da lagoa. Isso limita fotossíntese para plantas bentônicas, reduzindo alimento e habitat para organismos de fundo.
À medida que algas morrem e decompõem, bactérias consomem grandes quantidades de oxigênio. Isso pode criar condições hipóxicas ou anóxicas que estressam ou matam peixes e outra vida aquática.
Fotossíntese diurna intensa pode elevar pH e baixar níveis de dióxido de carbono. À noite, respiração inverte esse processo, causando queda de pH e aumento de CO2. Essas oscilações podem perturbar metabolismo e respiração de outros habitantes da lagoa.
Algumas espécies algais produzem toxinas nocivas que podem adoecer ou matar peixes, zooplâncton e outra vida aquática. Outras liberam químicos alelopáticos que inibem crescimento de organismos competidores, desestabilizando ainda mais o ecossistema.
No geral, florações algais perturbam equilíbrio delicado de ecossistemas de lagoa alterando teias alimentares, depletando oxigênio, introduzindo toxinas e ameaçando sobrevivência de diversos organismos aquáticos.