Em ambiente limpo e bem mantido, ratos são animais higiênicos que se limpam regularmente. Porém, com o tempo, cheiro de urina pode se acumular nas gaiolas. Este odor não é só desagradável, é prejudicial aos ratos. Acúmulo de amônia pode danificar permanentemente os pulmões destes pequenos animais. Desinfetar a gaiola com produtos não tóxicos a cada limpeza ajuda a reduzir odores e manter pets saudáveis.
Vinagre contém cerca de 5% de ácido acético. É bactericida leve, matando micróbios desagradáveis que se reproduzem em cama suja. Também reage com amônia na urina do rato para neutralizar o odor. Vinagre sai com água e não deixa resíduo perigoso. Em soluções muito fortes, pode deixar odor ácido leve, que desaparece com tempo. Dilua mais ou deixe secar em área bem ventilada antes de devolver ratos.
Peróxido de hidrogênio vem em dois graus, médico e técnico. O médico está disponível em farmácias e contém cerca de 3% deste químico. É levemente bactericida e também mata vírus e fungos. Oxida outras substâncias ao contato, decompondo em água e gás oxigênio. Não deixa resíduo ou cheiro. Comum como alvejante seguro para cores, também pode remover manchas de gaiolas além de odores.
Bicarbonato de sódio é material absorvente que suga odores no ar. Muitos usam caixa ou tigela aberta na geladeira para remover cheiros ruins. Mesmo princípio funciona para cheiros de rato. Polvilhe pouco bicarbonato no fundo da gaiola antes de adicionar forração, ou simplesmente coloque recipiente aberto perto da gaiola para reduzir odores. Esta técnica não permite limpeza menos frequente, mas reduz odores em espaço pequeno com pouca ventilação. Troque bicarbonato frequentemente para melhor eficácia.
Vários químicos naturais, adicionados à ração ou água dos ratos, reduzem odores da urina. Vendidos sob várias marcas, geralmente contêm aminoácidos ou yucca de Mojave, que fazem ratos produzirem urina menos fedorenta. Segundo o Rat and Mouse Club of America, ambas substâncias são suplementos alimentares seguros quando usadas conforme indicado.