Mutações genéticas referem-se à mudança permanente na sequência de DNA de um gene. As mutações podem ser herdadas de um progenitor ou adquiridas durante a vida de um animal ou humano. Os vários tipos de mutações incluem morfismo, adaptação comportamental e biológica e mutações pontuais. Pessoas criam cobras e outros animais para obter cores raras, nanismo e albinismo, mas mutações também podem ocorrer naturalmente, como na grande cobra-tigre da Ilha Chappell.
A mutação genética em cobras ocorre quando humanos criam seletivamente cobras com características de cor específicas. Se uma cobra vermelha e uma amarela cruzarem e nascerem todas vermelhas exceto uma laranja, o criador manterá a cobra laranja para cruzá-la com outra vermelha na esperança de que gere outra laranja. Pode levar várias gerações de criação para que o gene laranja, recessivo, se prove. Após realizar criação seletiva suficiente, provavelmente causará um morfismo.
Como a genética de uma cobra afeta várias de suas características, criadores também morfaram cobras para serem menores que o normal. Versões anãs de cobras, como as pítons reticulada e birmanesa, são criadas isolando as cobras mais fracas da ninhada e provando seus genes de nanismo ao longo do tempo, eventualmente causando crescimento atrofiado.
Como os genes determinam as propriedades das enzimas digestivas das glândulas salivares, sua mutação genética levou à criação do veneno de cobra, um fator significativo na evolução da cobra. Certas cobras desenvolveram veneno que afeta o sistema nervoso, enquanto outras desenvolveram veneno que ataca o sistema cardiovascular. Essas mutações são chamadas de mutações pontuais porque afetam um único ponto em um gene, possivelmente até uma única proteína.
Cobras se adaptam ao seu ambiente, causando mutações ao longo do tempo. As cobras-tigre da Ilha Chappell, na costa da Tasmânia, têm acesso muito maior a uma fonte abundante de alimento, o pássaro mutton bird, do que as cobras-tigre da Tasmânia. A versão da Ilha Chappell da cobra mudou ao longo do tempo, crescendo maior com glândulas de veneno e mandíbulas maiores para ajudá-las a consumir os muitos filhotes de mutton bird.