O esquilo-voador-de-Namdapha depende das florestas do Parque Nacional Namdapha. Desmatamento, exploração madeireira, desenvolvimento de infraestrutura e expansão agrícola estão encolhendo e dividindo seu habitat, isolando populações remanescentes.
Comunidades locais historicamente caçavam estes esquilos por pelagem e carne. Embora a espécie seja protegida dentro do parque, caça ilegal continua nas bordas. Seus hábitos arborícolas também os tornam vulneráveis a armadilhas destinadas a outros animais.
Estes esquilos dependem fortemente de certas espécies de bambu para alimento, abrigo e nidificação. Mudanças nos padrões de floração e frutificação do bambu, impulsionadas por mudanças climáticas e outros fatores, ameaçam seu suprimento alimentar.
Alterações em temperatura e chuva afetam recursos alimentares e habitat adequado. Eventos climáticos extremos como ciclones podem danificar ou destruir ocos de árvores que usam para abrigo.
Encontrado apenas em áreas específicas do Parque Nacional Namdapha, a espécie tem pequena distribuição geográfica. Esta distribuição restrita torna-a mais vulnerável que espécies amplamente distribuídas.
Apesar de seu status ameaçado, relativamente pouco se sabe sobre sua ecologia, comportamento e tendências populacionais. Esta lacuna de informação torna conservação eficaz difícil.
Proteger seu habitat, parar caça, restaurar áreas degradadas e aumentar pesquisa são essenciais para garantir a sobrevivência do esquilo-voador-de-Namdapha.