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Gatos Manx são doces e muito orientados para pessoas, frequentemente criados para ter apenas restos de vértebras da cauda ou cauda muito encurtada. Embora isso não cause problemas de agilidade e mobilidade, genes defeituosos de Manx frequentemente resultam em problemas espinhais e internos, diretamente devido à ausência de vértebras da cauda, nem sempre perceptíveis até Manx ter alguns meses. Presença do gene anormal é conhecida em ciência animal como Síndrome de Manx.
Em seu artigo de 2010 "O Gato em Pesquisa Biomédica", Michael Rand descreve proteína presente em fluido amniótico que resulta em malformações espinhais ou cerebrais em humanos e gatos Manx. O defeito mais comum é espinha bífida, em que vértebras não fecham ou são incompletas. Às vezes defeito é coberto por pele que se desenvolve normalmente, mas em muitos casos a falha genética de fusão está presente na pele, levando a defeito aberto.
Em estudo de 2004 "Distúrbios do Plexo Lombossacral", Marc Raff et al. descrevem presença ocasional de vértebras fundidas em gatos Manx. Conhecido como sacralização, ou fusão, como visto no desenvolvimento normal e estrutura do sacro humano, as últimas uma ou duas vértebras lombares fundem-se ao sacro felino e podem levar a dificuldades de mobilidade ou luxação de quadril. Gatos Manx frequentemente exibem dor, postura anormal e ocasionalmente ausência de função nervosa levando a trauma acidental que passa despercebido pelo gato.
Síndrome de Manx também frequentemente acompanhada por defeitos em órgãos internos e estruturas neurais relacionadas incluindo cérebro. Condições como meningocele e hidrocefalia são prováveis. Defeitos no desenvolvimento de órgãos internos podem afetar negativamente sistemas excretores como bexiga e intestinos, seja por defeitos de tecido ou dano neural, enquanto tecido de órgãos internos às vezes muta e funde com outras células em desenvolvimento como cartilagem ou osso.
Alguns gatos Manx têm caudas muito rudimentares, e criadores responsáveis tomam grande cuidado no cruzamento para reduzir ocorrência de Síndrome de Manx. Se gatos Manx nascem com cauda mais longa que uma ou duas vértebras, pesquisa encontrou que após alguns anos, ossificação dos ossos da cauda causa grande desconforto. Amputação da cauda causa muito mais desconforto no gato adulto do que se cauda for amputada dentro de poucos dias após nascimento.