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Uma anatoxina é uma pequena quantidade de toxina morta ou modificada utilizada para produzir imunidade. As anatoxinas são empregadas em vacinas para estimular o sistema imunológico a criar anticorpos contra a toxina, sem causar a doença.
Quando uma pessoa é vacinada com uma anatoxina, o sistema imunológico produz anticorpos que se ligam à toxina e a impedem de danificar as células, protegendo assim o indivíduo da doença.