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A truta respira através de suas brânquias. Gills são órgãos especializados que extraem oxigênio da água. Eles estão localizados em ambos os lados da cabeça da truta e são compostos de filamentos finos e de penas. Cada filamento é coberto por pequenos vasos sanguíneos, que absorvem oxigênio da água. Enquanto a truta respira, ela atrai a água pela boca e passa por suas brânquias. O oxigênio na água é absorvido pelos vasos sanguíneos nas brânquias, e a água é então expulsa pelas fendas em branqueamento da truta. As brânquias da truta são muito eficientes para extrair oxigênio da água e permitem que a truta respire, mesmo em ambientes relativamente baixos de oxigênio.