Os dragões de Komodo têm poucos predadores como adultos devido à sua mordida venenosa e tamanho impressionante como espécies dominantes nas ilhas onde habitam. Os seres humanos são seus principais predadores, representando ameaças de caça furtiva ilegal e destruição de habitats causados pela atividade humana.
Como jovens, alguns predadores incluem predadores maiores, como o Python reticulado ou grandes aves de rapina, incluindo a águia filipina ou a cegonha de Marabou. Outros dragões adultos matam e canibalizam os jovens na presença de escassez de alimentos.